Dans la phase de démarrage de ses activités, la Banque de l'habitat du benin (BHB) n'a qu'un seul guichet. Il est situé au siège, Boulevard de France à Cotonou.

Toutefois, un accord de partenariat signé avec la BANK OF AFRICA - BENIN (BOA - BENIN) met les agences et bureaux de cette dernière à disposition des clients de la BHB pour qu'ils y effectuent leurs opérations courantes.

Dans les pays où la BOA est présente, les opérations de transfert de fonds peuvent être effectuées à des conditions préférentielles vers la BHB, de même que les échanges d'informations y seront facilités.